زمان مصرف کودهای آلی نیز ممکن است متفاوت باشد. برخی از کودهای آلی مانند کمپوست و کود حیوانی می‌‌توانند قبل از کاشت گیاهان به خاک افزوده شوند تا بهبود ساختار و حاصلخیزی خاک را تسهیل کنند. همچنین، می‌‌توانید در طول فصل رشد گیاهان هم از کودهای آلی به عنوان یک منبع تغذیه طبیعی برای گیاهان استفاده کنید. برخی از کودهای آلی مانند کمپوست می‌‌توانند به صورت منظم و دوره ای استفاده شوند.
مصرف کود دامی‌بسته به فصل متفاوت است. در بهار و تابستان کود مرغی به دلیل سرعت تجزیه و نیتروژن بالا مناسب‌تر است، در حالی که در پاییز و زمستان کود گاوی به دلیل تجزیه آهسته و تغذیه طولانی‌مدت ارجحیت دارد.
کود دامی‌یکی از مهم ترین و پرکاربردترین انواع کودهای آلی است که از فرآیند تجزیه مواد دفعی حیوانات حاصل میشود. این کود دارای مقادیر قابل توجهی از مواد مغذی مانند نیتروژن، فسفر و پتاسیم است و همچنین حاوی مواد آلی فراوان که باعث افزایش حاصلخیزی و بهبود ساختار خاک میشود آز آن جایی که عناصر غذایی مورد نیاز در گیاه در کود دامی‌به آرامی‌در خاک آزاد و به آهستگی جذب گیاه می‌شوند، بنابراین این کود را باید در مراحل پایه و قبل از کاشت محصولات بلندمدت مانند باغات و زراعت استفاده می‌‌گردد. همچنین این کود در بخش کشاورزی ارگانیک و پایدار نیز کاربرد فراوانی دارد.
کودهای آلیمانند کود مرغی و دامی‌به دلیل ترکیب شیمیایی و ساختار متفاوت خود، سرعت آزادسازی عناصر غذایی مختلفی دارند. کود مرغی به دلیل داشتن ترکیبات نیتروژن و فسفر قابل حل در آب و مواد آلی ساده‌تر، به سرعت توسط میکروارگانیسم‌های خاک تجزیه میشود و عناصر غذایی آن به سرعت در دسترس گیاهان قرار می‌گیرد. در مقابل، کود دامی‌حاوی مواد آلی پیچیده‌تر و سلولز بیشتری است که تجزیه آنها زمان بیشتری می‌برد. این تفاوت در ساختار و ترکیبات شیمیایی باعث میشود که کود مرغی سریع‌تر آزاد شود و کود دامی‌به صورت کند رهش عمل کند، به این معنی که تغذیه طولانی‌مدت‌تری را برای گیاهان فراهم می‌کند.
برخلاف کود دامی، کود مرغی به عنوان یک کود آلی سریع رهش (عناصر غذایی به سرعت در خاک آزاد و جذب گیاه می‌شوند) شناخته میشود. این کود علاوه بر داشتن مقادیر بالاتری از نیتروژن، فسفر و پتاسیم نسبت به کود دامی، حاوی مواد آلی قابل تجزیه زیستی بیشتری است. کود مرغی به دلیل جذب سریع تر عناصر غذایی، بیشتر در مراحل پوششی و پس از سبز شدن محصولات زراعی و باغی مورد استفاده قرار می‌گیرد. همچنین این نوع کود در کشت های گلخانه ای و محصولات با رشد سریع نیز کاربرد دارد. میزان مصرف کودهای آلی مختلف بسته به نوع گیاه و شرایط زراعی متفاوت است.