تمامی‌فرآیندهای طبیعی و اکوسیستم دارای چرخه‌‌‌ای پایدار هستند که به دلیل دخالت‌های انسانی نابود می‌شوند. ساختار زیستیخاک نیز دارای چرخه‌‌‌ای از عناصر غذایی مفید است که نقشی حیاتی در سلامت خاک ایفا می‌کنند. میکروارگانیسم‌های موجود در خاک بخشی مهم و اساسی از ساختار خاک به شمار می‌روند و وظیفه تجزیه مواد آلی را برعهده دارند. میکروارگانیسم‌ها بخشی از اکوسیستم زنده خاک هستند و بیشترین آسیب را بعد از مصرف کودهای شیمیایی متحمل می‌شوند.
تأمین غذای میکروارگانیسم‌ها:
کود کاملغذای مورد نیاز میکروارگانیسم‌های موجود در خاک را تأمین می‌کند و همین امر سبب می‌شود تا میکروارگانیسم‌ها با سرعت بیشتری مواد آلی موجود در خاک را تجزیه کنند. به همین دلیل اگر همراه با کودهای کامل شیمیایی از کودهای آلی و کمپوست‌ها استفاده نکنید، پایداری خاک از بین می‌رود.
تعادل بین مواد شیمیایی و مواد زیستی:
اگر کودهای آلی و کودهای کامل شیمیایی به اندازه متعادل و همراه با یکدیگر مورد استفاده قرار بگیرند، سلامتی خاک بازیابی می‌شود و تنوع زیستی خاک تقویت می‌شود.